Lavendelkwarts is een variant kwarts en vormt zich in de basis ook op dezelfde wijze als kwarts kristallen. Kwarts is een vorm van siliciumdioxide (SiO₂) en een van de meest voorkomende mineralen in de aardkorst. Het kristal is een verbinding tussen silicium en zuurstof. De vorming van lavendelkwarts begint met de neerslag van silicaatoplossingen in holtes en scheuren in gesteenten. Over het algemeen wordt het gevormd in geologische formaties zoals pegmatieten, hydrothermale aders en sedimentaire gesteenten. Deze oplossingen bevatten kleine hoeveelheden ijzer, aluminium en lithium die verantwoordelijk zijn voor de paarse kleur. Deze elementen reageren met het kwarts tijdens de groei en geven het mineraal de karakteristieke tint.